A la izquierda, aspecto actual del presbiterio tras la supresión del Crucificado de presidencia labrado por el escultor e imaginero ayamontino Antonio León Ortega (1968), hoy conservado en la Ermita de Nuestra Señora de la Soledad, y la colocación de la monumental talla de la Purísima Concepción en un retablo recompuesto con elementos antiguos. Se trata de una de las pocas zonas conservadas de la arquitectura primitiva del templo, de estilo gótico-mudejar (siglo XVI). La Virgen es obra de Antonio Castillo Lastrucci (1939).

A la derecha, espléndida imagen del Sagrado Corazón de Jesús labrada por el escultor e imaginero onubense Sebastián Santos Rojas (1939) que preside la capilla sacramental del templo, en la cabecera de la nave de la Epístola. La devoción goza de gran arraigo en Huelva gracias al arciprestazgo del beato Manuel González García a principios del siglo XX. Muestra notables relaciones con otras piezas realizadas sobre el mismo tema por el escultor, caso de la que preside la Parroquia de la Asunción del municipio onubense de Almonte.

Uno de los dos sugestivos lienzos que el pintor, imaginero y restaurador Mario Ignacio Moya Carrasco ha pintado para los laterales del presbiterio. Representa el pasaje de La Anunciación, versionando libremente el autor la inmortal pieza de Fra Angelico que se conserva en el madrileño Museo del Prado.

Dos de las imágenes titulares de la Cofradía de la Vera Cruz y Oración en el Huerto. El Cristo de la Oración en el Huerto es obra del escultor e imaginero gaditano Luis Ortega Bru (1977), quien también realizó el apostolado que cada Jueves Santo figura en su paso de misterio. La Virgen de los Dolores es una de las primeras obras del artista sevillano Luis Álvarez Duarte (1967). Fue restaurada en su taller en el año 2004.

Cristo de la Vera Cruz, tercer titular de la anterior corporación. Fue presentado el 14 de noviembre de 2005 en la Casa Colón de Huelva, correspondiendo su hechura al joven escultor e imaginero sevillano Mariano Sánchez del Pino. Apuntar que su hermandad no recuperará el interesante retablo neobarroco que poseía en su capilla de la cabecera de la Nave del Evangelio antes de la restauración del templo. Ello es debido, según la cofradía, al mal estado de conservación que presenta el mismo, aunque tampoco hubiera sido posible reintegrarlo con la inclusión de este nuevo Crucificado debido a la falta material de espacio en la capilla.

Otro de los cuadros de Mario Ignacio Moya Carrasco para el presbiterio. En esta ocasión, la escena representa a María y José Adorando al Niño, con el establo al fondo y un rompimiento de gloria con ángeles sobre el Divino Infante. Las influencias flamencas e italianas se advierten tanto en la intimista composición como en el socorrido uso del paisaje para otorgar profundidad a la escena.

La Virgen de la Amargura y San Juan Evangelista, titulares de la Cofradía del Nazareno. Son obras del escultor e imaginero valenciano, afincado en Jerez de la Frontera, Ramón Chaveli Carreres (1938-1940), restauradas por Sebastián Santos Rojas y más recientemente por Enrique Gutiérrez Carrasquilla. Para el solemne traslado al templo, la Dolorosa lució el manto procesional de la Virgen de la Soledad, perteneciente a la Cofradía de la Vera Cruz de la localidad onubense de Moguer. Sus antiguos retablos, en madera oscura con apliques dorados, han sido reemplazados por otros de mármol.

A la izquierda, imagen de Jesús Nazareno, titular de la cofradía del mismo nombre, obra magistral de Sebastián Santos Rojas (1950) que también fue intervenida en el año 2005 por el restaurador sevillano Enrique Gutiérrez Carrasquilla. En la fotografía de la derecha podemos contemplar su nuevo retablo, realizado por los talleres almerienses de Mármoles Cuéllar. Sigue el diseño de arco de medio punto del anterior y ostenta el escudo de la corporación en su remate.

Histórica foto que muestra al titular de la Cofradía de la Oración en el Huerto entrando en el templo tras casi ocho de años de exilio forzoso por la restauración del mismo. Se observan detalle como la nueva techumbre, en madera de pino en su color para diferenciarla de las partes antiguas del inmueble, y el realista modelado de los pies que el gran Luis Ortega Bru imprimió en la efigie pasionista.